CLASSIFICAÇÃO - GRUPOS E SUB-GRUPOS
Outro sistema classifica os fitoplasmas em Grupos e Subgrupos baseado no "fingerprint" (Teste de PCR – RFLP), do fragmento genômico de 1.2 kb do16SrDNA delimitado pelos locais de anelamento dos iniciadores ("primers") R16F2n (5' - gAA ACg ACT gCT AAg ACT gg - 3' e R16R2 (5' - TgA Cgg gCg gTg TgT ACA AAC CCC g - 3') através do Teste de nested PCR.
Cada grupo é designado por um número romano e o subgrupo por uma letra alfabética. Similaridades no modelo do RFLP entre DNA de diferentes fitoplasmas podem ser calculadas e expressas em Coeficiente de Similaridade.
Atualmente, estão sendo usados outros genes (por exemplo, SecY) para diferenciação a nível de estirpe.
Tabela 1. Grupos e Sub-grupos, até 2015, relacionados com a análise por RFLP de parte da sequência do gene 16S rRNA de fitoplasma.
GRUPO RFLP do gene 16Sr RNA |
SUB-GRUPO RFLP do gene 16Sr RNA |
16SrI |
A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R |
16SrII |
A, B, C, D, E, F |
16SrIII |
A, B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T, U, V, W, X, Y |
16SrIV |
A, B, C, D |
16SrV |
A, B, C, D, E, F, G |
16SrVI |
A, B, C, D, E, F, G, H, I |
16SrVII |
A, B |
16SrVIII |
A |
16SrIX |
A, B, C, D |
16SrX |
A, B, C, D, E, F |
16SrXI |
A, B, C |
16SrXII |
A, B, C, D, E |
16SrXIII |
A, B |
16SrXIV |
A |
16SrXV |
A, B |
16SrXVI |
A |
16SrXVII |
A |
16SrXVIII |
A |
16SrXIX |
A |
16SrXX |
A |
16SrXXI |
A |
16SrXXII |
A |
16SrXXIII |
A |
16SrXXIV |
A |
16SrXXV |
A |
16SrXXVI |
A |
16SrXXVII |
A |
16SrXXVIII |
A |
16SrXXIX |
A |
16SrXXX |
A |
16SrXXXI |
A |