TAXONOMIA
[http://www.taxonomicoutline.org/index.php/toba/article/view/185/217; http://plantpathology.ba.ars.usda.gov/pclass/pclass_phytoplasmaclassification_system2.html]
Neste sistema, os Phytoplasmas sp. e os 'Candidatus Phytoplasmas sp.' (possíveis espécies), são classificados de acordo com a sequência nucleotídica do gene 16S rRNA, após alinhamento e comparação com sequências de diferentes fitoplasmas onde se calcula a porcentagem (%) de identidade nucleotídica.
Identidade de sequência nucleotídica do gene 16S rRNA igual ou menor do que 97,5% = espécies distintas
| DOMÍNIO | REINO | SUBREINO | FILO | CLASSE | SUBCLASSE | ORDEM | FAMÍLIA | GÊNERO | ESPÉCIE |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Bacteria | Bacteria | Posibacteria | Thermotogae | Thermotogae | Thermotagales
|
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| Firmicutes | Bacilli | Bacillales | |||||||
| Clostridia | Lactobacillales | ||||||||
| Clostridiales | |||||||||
| Halanaerobiales | |||||||||
| Thermoanaerobacterales | |||||||||
| Natranaerobiales | |||||||||
| Erysipelotrichia | Erysipelotrichales | ||||||||
| Thermolithobacteria | Thermolithobacterales | ||||||||
| Negativicutes | Selenomonadales | ||||||||
| Tenericutes | Mollicutes | Mycoplasmatales |
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| Entomoplasmatales | |||||||||
| Acholeplasmatales | Acholeplasmataceae | Phytoplasma | Phytoplasma sp.' | ||||||
Anaeroplasmatales |
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| Actinobacteria | Actinobacteria | Acidimicrobidae | Acidimicrobiales | ||||||
| Rubrobacteridae | Rubrobacterales | ||||||||
| Solirubrobacterales | |||||||||
| Thermoleophilales | |||||||||
| Coriobacteridae | Coriobacteriales | ||||||||
| Actinobacteridae | Actinomycetales | ||||||||
| Bifidobacteriales | |||||||||
| Nitriliruptoridae | Nitriliruptorales | ||||||||
| Euzebyales | |||||||||
| Dictyoglomi | "Dictyoglomia" | "Dictyoglomales" | |||||||
CLASSIFICAÇÃO
Outro sistema classifica os fitoplasmas em Grupos e Subgrupos baseado no "fingerprint" (Teste de PCR – RFLP), do fragmento genômico de 1.2 kb do16SrDNA delimitado pelos locais de anelamento dos iniciadores ("primers") R16F2n (5' - gAA ACg ACT gCT AAg ACT gg - 3' e R16R2 (5' - TgA Cgg gCg gTg TgT ACA AAC CCC g - 3') através do Teste de nested PCR.
Cada grupo é designado por um número romano e o subgrupo por uma letra alfabética. Similaridades no modelo do RFLP entre DNA de diferentes fitoplasmas podem ser calculadas e expressas em Coeficiente de Similaridade.
Atualmente, estão sendo usados outros genes (por exemplo, SecY) para diferenciação a nível de estirpe.